税务部门在人工费用核查中的16项重点检查内容

摘要

随着高新技术企业税收优惠政策的深入实施，监管体系正从形式审查全面转向实质性与穿透式核查。在这一背景下，“科技人员”作为高企认定的核心定量指标，其管理的真实性与规范性已成为企业维持资质、享受政策红利的关键风险控制点。本文基于近期专项税务督察审计所揭示的3大类典型问题，系统梳理了税务部门在人工费用核查中的16项穿透式检查要点，深入解析了监管的核心逻辑与高风险领域。在此基础上，构建了包含12项管理要点的科技人员全周期规范化管理体系，形成“入口甄别—过程管控—结果验证”的闭环管理框架，旨在为高新技术企业提供一套可操作、可验证的合规实践指南，助力企业在严格的监管环境下筑牢根基，实现持续、稳健的创新发展。

鉴于内容的专业深度与实践指导性，本文分三期连载发布（此篇为系列之二），后续篇章将详解管理落地路径，敬请持续关注。

系列之一：督察审计视角下的科技人员管理风险   

系列之二：税务部门在人工费用核查中的16项重点检查内容

系列之三：科技人员全周期规范化管理体系的12项管理要点

随着高新技术企业税收优惠政策的持续深化，税务监管重心已由“资料形式合规”全面转向“业务实质真实”。在研发费用加计扣除及高企资格复核中，人工费用因其归集弹性大、证据链条长，成为穿透式核查的核心。税务机关围绕科技人员管理全流程，已构建起一套精准、系统的核查体系，重点关注其岗位匹配、工时记录与费用分摊的实质逻辑。这不仅关乎加计扣除金额的合规性，更直接关系到企业高新技术资格的存续与安全。为帮助企业筑牢合规防线、有效应对监管升级，本文系统梳理了税务部门在人工费用专项核查中的十六项重点，并且将在本系列第三期提供清晰的合规指引，助力企业在享受政策红利的同时行稳致远。

一 人员名单与费用一致性核查

获取全体员工花名册及岗位明细，核对科技人员名单，并比对立项决议书中所列人员，确认项目列支的人工费用是否一致，是否存在多列、虚列或错列情形。

二 人员费用占比合理性分析

结合企业科技人员数量及结构，分析其人员人工费用占研发费用总额的比例，并与同行业可比企业进行横向对比，判断是否存在显著偏高或偏低等异常情形，以识别潜在的费用归集不实或人员配置不合理问题。

三 部门职能与岗位匹配核查

要求企业提供《部门职能手册》，重点审查科技人员（尤其是来自非研发部门的人员）所在岗位的职责描述中，是否明确包含直接参与研发或提供直接技术服务的内容，以判断其纳入科技人员范围的合理性。

四 非技术部门人员合规性审查

审查是否将市场、财务、人事、行政等明显非技术类职能部门人员纳入科技人员统计范围。此类人员若无直接研发职责或技术服务内容，通常不符合高企认定中对科技人员的定义。

五 科技人员资质能力审查

核查科技人员的学历、专业背景及技能水平，评估其是否具备承担研发任务的能力，排查是否存在“挂名”科技人员的情况。

六 高管参与研发真实性审查

核查科技人员中是否包含高管。如包含，需说明其具体参与的研发工作内容，并重点评估其申报的研发工时是否合理、真实；相关管理与研发工作职责如何安排和分配；相关薪酬费用全部或按固定比例计入研发费用的合理性。

七 科技人员口径差异核查

关注企业在高新技术企业认定与研发费用加计扣除中所列科技人员范围是否存在差异，要求企业说明差异原因，并结合岗位职责、实际参与情况等判断其合理性与合规性。

八 研发工时统计真实性核查

了解企业研发工时的统计方式及审核机制，核实科技人员实际投入研发的时间，防止将非研发工作时间计入研发工时。

九 全额工时归集合理性审查

重点关注将人工费用100%全额计入研发费用的人员，核查其是否同时从事非研发工作。如是否存在兼岗情况，是否未区分非研发工时而直接全额归集，违反分摊原则。

十 职责分工与实际参与度评估

通过了解科技人员的具体职责和团队分工，判断其是否实质性参与研发活动，防范虚列科技人员行为。

十一 研发过程资料完整性查验

要求科技人员提供研发日志、实验记录、阶段性报告等过程性文档，以佐证其实际参与研发活动。

十二 科技人员访谈与核验

对科技人员开展访谈，重点核实以下内容：

（1）专业背景与技能情况；

（2）参与的具体研发项目、项目内容、解决的技术难题及创新点；

（3）在项目中的具体职责与贡献；

（4）研发成果及产出形式；

（5）工时记录方式和审批流程；

（6）研发费用的报销和审批流程。

十三 兼职人员费用分摊合规性核查

对同时从事研发与生产（或其他非研发）活动的人员，核查企业是否建立相应活动记录，并采用合理方法（如工时占比）在研发费用与生产成本之间进行费用分摊。

十四 多项目人员费用分摊合理性审查

对同一人员同时参与多个研发项目的，核查是否依据实际工时占比等合理方法在各项目间分摊人工费用，并查验是否有原始工时记录及合理的分配计算依据。

十五 五险一金计提匹配性审查

检查五险一金的计提比例是否与实际发放工资相匹配，费用结构是否合理。

十六 福利费归类合规性审查

核查是否将职工福利费错误计入“人员人工费用”。根据政策规定，职工福利费应归入“其他相关费用”，并受不超过可加计扣除研发费用总额10%的限额约束。

总结

当前，税务部门对科技人员及相关人工费用的核查已全面由“形式合规”转向“实质真实”，聚焦四大核心原则：岗位匹配性、工时准确性、分摊合理性、资料完整性。

企业若仅满足于表面材料合规，而缺乏系统化的研发过程管理制度、严谨的工时记录支撑以及清晰的费用归集分摊逻辑，将面临巨大风险。在当前的监管态势下，任何环节的疏漏都可能导致高新技术企业资格存疑、研发费用加计扣除被调减，并需补缴税款及滞纳金，使企业蒙受经济和声誉的双重损失。

为此，企业亟需将合规要求嵌入研发管理日常流程，构建覆盖人员准入、过程留痕到成果归档的全周期证据链，切实做到“制度筑基、过程留痕、逻辑自洽”。唯有如此，方能在监管趋严的背景下，既安全享受政策红利，又稳固高新技术企业资质，实现创新与合规的协同发展。